Согласно абзацу второму пункта 3 статьи 161 НК РФ при реализации (передаче) на территории РФ муниципального имущества, не закрепленного за муниципальными предприятиями и учреждениями, составляющего муниципальную казну соответствующего городского, сельского поселения или другого муниципального образования, налог на добавленную стоимость уплачивается налоговыми агентами - покупателями (получателями) указанного имущества.

При этом указанные лица обязаны исчислить расчетным методом, удержать из выплачиваемых доходов и уплатить в бюджет соответствующую сумму налога.

Таким образом, исчисление суммы НДС производится покупателем - налоговым агентом при оплате имущества в момент оплаты (частичной оплаты) имущества, в том числе первого платежа и последующих.

Такие разъяснения приводит УФНС по Саратовской области на ведомственном сайте.