Начиная с первого квартала 2008 года, декларация по налогу на добавленную стоимость представляется ежеквартально.
Заполнение деклараций производится в соответствии с Приказом Минфина России от 07.11.2006 N 136н "Об утверждении формы налоговой декларации по налогу на добавленную стоимость и Порядка ее заполнения".

Титульный лист и раздел 1 декларации представляют все налогоплательщики.
Разделы 2 - 9, а также приложение к декларации включаются в состав представляемой в налоговые органы декларации при осуществлении налогоплательщиками соответствующих операций.

Декларацию по НДС необходимо заполнить в следующей последовательности:
1) разд. 3;
2) разд. 5;
3) разд. 6;
4) разд. 7;
5) разд. 8;
6) разд. 1;
7) разд. 2;
8) разд. 4;
9) разд. 9;
10) титульный лист.

Такой порядок заполнения декларации объясняется тем, что данные разд. 3, 5, 6, 7, 8 нужны для заполнения разд. 1. Для заполнения титульного листа необходимо знать общее количество заполненных страниц декларации, поэтому он заполняется в последнюю очередь.

Из названия разд. 3 можно сделать вывод, что в нем следует отражать данные по совершенным в налоговом периоде операциям по реализации товаров (работ, услуг), которые облагаются по ставкам 10 и 18%, а также расчетным ставкам 10/110 и 18/118 (п. п. 2 - 4 ст. 164 НК РФ).

В разделе 3 можно выделить два подраздела: «Налогооблагаемые объекты» и «Налоговые вычеты» Во второй части разд. 3 отражаются суммы НДС, которые налогоплательщик принимает в истекшем налоговом периоде к вычету на основании:
- ст. ст. 171 и 172 НК РФ;
- п. 8 разд. I Положения;
- ст. ст. 2 и 3 Закона N 119-ФЗ.

Раздел 1 декларации включает в себя показатели сумм налога, подлежащих уплате в бюджет (возмещению из бюджета), по данным налогоплательщика
По строке 040 отражается сумма налога, исчисленная к уплате в бюджет за налоговый период, которая зачисляется на указанный в строке 010 код бюджетной классификации.

Сумма налога отражается по строке 040, если величина разницы суммы строк 350 раздела 3, 030 раздела 7 и суммы строк 360 раздела 3, 030 раздела 5, 060 раздела 6, 040 раздела 7, 060 раздела 8 больше или равна нулю.

По строке 050 отражается сумма налога, исчисленная к возмещению из бюджета за налоговый период, подлежащая в установленном порядке зачету или возврату из бюджета, которая учитывается по коду бюджетной классификации, указанному в строке 010.

Сумма налога отражается по строке 050, если величина разницы суммы строк 350 раздела 3, 030 раздела 7 и суммы строк 360 раздела 3, 030 раздела 5, 060 раздела 6, 040 раздела 7, 060 раздела 8 меньше нуля.

При заполнении показателя строки 040 (либо 050) сумма налога отражается в рублях путем заполнения ячеек начиная с наименьшего разряда числа справа налево, в остальных ячейках нули не отражаются.